西罗马帝国灭亡后，欧洲进入了近千年政教合一的中世纪时期，教权统治使文化、哲学、科学、艺术等领域都附庸于神学。彩绘玻璃作为一种艺术形式在这个时期发展达到巅峰，在教堂装饰中运用空前。
拥有850年历史的巴黎圣母院是巴黎最古老的建筑之一，大教堂的石头雕刻和几百年历史的迷人彩色玻璃窗是大教堂最吸引人的一部分。
随着禁令的毁灭浪潮席卷而来，传统彩绘玻璃的技艺几乎失传，直到下一个世纪才被重新发现。19世纪初，英格兰天主教复苏，带动了中世纪教堂哥特式风格的复兴，约翰·罗斯金等人拥护“真正的天主教风格”。许多古老的教堂得到恢复，也促进了彩绘玻璃窗制作的复兴。法国许多教堂在大革命期间也遭到了破坏，从1824年开始，法国瓷器制造商开始生产彩绘玻璃以适应这个时代修复教堂的需求，有许多中世纪优美的彩绘花窗得到了恢复。
这种独特的玻璃窗花艺术在12世纪和13世纪的哥特式艺术时代达到顶峰。尤其以哥特式教堂内的彩色玻璃窗最为出名。
彩色玻璃窗的使用在12世纪中叶得到了普及，圣丹尼斯的修道院院长苏格被称为“彩色玻璃之父”，因为是他首次概念化地使用彩色玻璃窗来创造一种“天堂之光”，被视为上帝在教堂中的存在
